Die Fontane-Klinik ist ca. 45 km vom Stadtzentrum von Berlin entfernt und liegt im Landschaftsschutzgebiet am Töpchiner See, nahe der Stadt Motzen im Dahmeland.
Die Gemeinde Aukrug steht im Mittelpunkt des Naturparks Aukrug mit vielen Wälder, Teiche, Bäche, Wiesen und Feldern. Der Naturpark Aukrug ist einer der waldreichsten Gebiete Schleswig-Holsteins und läd zum Wandern und Erholen ein.
Der Strand von Amrum ist feinsandig und breit. Hier herrscht das ganze Jahr ein wohltuendes mildes Meeresreizklima, welches einen spürbaren Einfluss auf die erfolgreiche Linderung und Heilung von verschiedenen Erkrankungen hat.
Von dem ca. 16 Hektar großen Grundstück der Fachklinik führt ein direkter Bohlenweg zum kilometerlangen Amrumer Sandstrand.