Die Klinik am See befindet sich am östlichen Stadtrand von Berlin, aber noch innerhalb des Berliner Rings, an der Verbindungsstraße zwischen Rüdersdorf und Woltersdorf, direkt neben dem Krankenhaus Woltersdorf.
Zum beliebten Ausflugsziel Woltersdorfer Schleuse sind es ca. 800 m.